读博去日本还是美国？
作为在日留美回的PhD，谈谈对两个国家的科研体制的看法吧。 先谈日本。 如果题主将来想在美国发展，那日本绝对是个很好的跳板——低廉的生活费、学费（免费）和强大的科研基础使得在日本留学的美国学生能够把精力完全放在学习研究上而不是赚钱生活上。而且日本教授给PhD的一般都是配电脑的，所以经济压力真的很小。
日本的博士课程以“修士”制度进行，4年制。前2年是上课，跟研究生一样，后2年才正式进入研究课题。虽然理论上第4年要考论文答辩才能毕业，但实际上基本上第三年末学校就会让学生们开始准备毕业论文了，第四年顺利的话就能拿到学位。这样的学制比美国的3+X学制的在读时间要短，但是需要指出的是日本博士的“4年”其实是有效学习时间的计算单位，不是严格意义上的4年期。例如我本人从入学到获得博士学位只用了3.5年（修士2年+博士1.5年），但是这3.5年里我一直都没有停过工作。
因为日本的研究员(Assoc Prof)以上级别是有税收优惠的，所以即使年薪高也并不会有太可观的收入，一般情况是70-80万日元（2-3万人民币）一个月，好点的项目能多挣点（比如我在的研究院因为有政府支持所以钱还是比较好拿的），但是总体来说跟美国比真的是少太多了。另外日本的办公室和实验室是没有空调的……夏天热得像火炉，冬天冷得直哆嗦，这也是一种额外支出吧。 再来说美国。 我申请的MS和PhD是同一个专业同一方向，因此能对比的项目并不多。就我了解到的来说，在奖学金方面美国显然是要比日本丰富很多的，只要你能找到愿意资助你的老板，那基本不用为经费发愁。 但是美国的文科PhD一般是没有奖学金的（除了最顶尖的那几个学校），像我们这种做理工农医的人机会会大很多。
美国是Master/Doctoral student一起申请，所以不能像日本一样以本科直博的方式申请到全奖。但是！美国有一个很强的优势——如果有幸被拒，你可以转申其他学校以增加被录取的机会；而如果申请到了部分奖学金（即使是半奖也是很不错的啦~）那么转学也是被允许的（当然你也要考虑是否值得放弃已得到的名额的问题）。
综上所述呢，如果以就业为最终目标的话建议申请美国，以深造为目的那就选日本。至于生活成本啊移民政策啊签证难易度啊这些因素在这里真的没法具体讨论，还是要看你所选择的方向和你所接触到的老师的想法。不管怎么说，祝好运咯～